まず石が浄化されている状態を考える必要があります。
石が浄化されているのは気も念も入っておらず
何もされていないクリーンな状態の事です。
当たり前のことですが見抜くのは難しいと思います。

しかし、ほぼ石に何の気も入っていないと言うとはありえません。
環境である自然の気が石に染みついているものです。
普通はそれが石の浄化された状態になります。
例えば海辺の石は砂浜と同じ気配がするなどの感じです。

環境である気はその場所に住んでいる
霊に染みついている事があるので
霊が浄化を行うと違う場所にいる
環境の気が石に入り込む事があります。

浄化は２通りあり、入っている気を抜く浄化と
気を入れ込んで押し流す浄化になります。
（例）スピリチュアルサロンの浄化は
サロンにある気を入れて押し流す浄化

何をしても石を浄化できない時があります。
これは石が悪くなったのでは無く

意思のある霊が石に入り込んでいます。
こうなってしまっては普通の人には浄化は難しいです。
時間をかけるかプロに浄化してもらうしかないでしょう。